Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ubqln4Q99NB8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ubqln4Q99NB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ubqln4Q99NB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ubqln4Q99NB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ubqln4Q99NB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubqln4Q99NB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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