Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcgf6Q99NA9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcgf6Q99NA9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms