Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm2d1Q99MB3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms