Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcf2Q99LE6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms