Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlgn1Q99K10 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlgn1Q99K10 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlgn1Q99K10 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms