Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sirt1Q923E4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sirt1Q923E4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sirt1Q923E4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms