Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek8Q91ZR4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nek8Q91ZR4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek8Q91ZR4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek8Q91ZR4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms