Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp4Q8VHC5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp4Q8VHC5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp4Q8VHC5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms