Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap2Q8VC34 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpap2Q8VC34 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms