Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ApobrQ8VBT6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ApobrQ8VBT6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms