Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spire2Q8K1S6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spire2Q8K1S6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms