Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrit1Q8K099 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrit1Q8K099 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrit1Q8K099 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms