Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nupl2Q8CIC2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nupl2Q8CIC2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms