Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp27Q8CEG8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms