Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228aQ8CDW1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam228aQ8CDW1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms