Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp1Q8C8U0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp1Q8C8U0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfibp1Q8C8U0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms