Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alx1Q8C8B0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alx1Q8C8B0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms