Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol7cQ8C6E1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7cQ8C6E1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms