Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ClmnQ8C5W0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ClmnQ8C5W0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms