Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp1Q8C4U3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp1Q8C4U3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms