Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim35Q8C006 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim35Q8C006 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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