Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmo3Q8BZL8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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