Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc30Q8BVF4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms