Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik4Q8BMF5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik4Q8BMF5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms