Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spock3Q8BKV0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spock3Q8BKV0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spock3Q8BKV0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms