Protein–RNA interactions for Protein: Q80WK2

Slc51b, Organic solute transporter subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc51bQ80WK2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc51bQ80WK2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc51bQ80WK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc51bQ80WK2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms