Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc93Q7TQK5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1029.4 ms