Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HhipQ7TN16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HhipQ7TN16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HhipQ7TN16 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms