Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rph3alQ768S4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms