Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms