Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ggnbp1Q6K1E7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ggnbp1Q6K1E7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms