Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lcn12Q6JVL5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn12Q6JVL5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lcn12Q6JVL5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms