Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms