Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx11Q6AXC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx11Q6AXC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms