Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pds5aQ6A026 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pds5aQ6A026 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms