Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fnip1Q68FD7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fnip1Q68FD7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fnip1Q68FD7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms