Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp9cQ66X01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms