Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1024.7 ms