Protein–RNA interactions for Protein: Q61712

Dnajc1, DnaJ homolog subfamily C member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc1Q61712 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc1Q61712 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc1Q61712 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc1Q61712 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms