Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms