Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acvr1bQ61271 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acvr1bQ61271 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms