Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mre11Q61216 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms