Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2aQ61194 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pik3c2aQ61194 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pik3c2aQ61194 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2aQ61194 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms