Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Astn1Q61137 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Astn1Q61137 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Astn1Q61137 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Astn1Q61137 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Astn1Q61137 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Astn1Q61137 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms