Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cln3Q61124 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cln3Q61124 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln3Q61124 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms