Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3Q60803 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms