Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a1Q60714 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a1Q60714 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a1Q60714 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms