Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms