Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms