Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim58Q5NCC9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim58Q5NCC9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms